La Unidad Educativa Fiscomisional San Pedro Pascual cuenta con un Laboratorio de Química en excelentes condiciones, dotado de los medios necesarios para realizar experimentos, prácticas y trabajo de carácter científico, en el que se desarrollan diferentes procesos experimentales que son parte de la formación académica y práctica por medio de la aplicación de los conocimientos impartidos en las aulas desde los octavos años de educación básica, además el laboratorio se encuentra equipado con instrumentos de medida, sustancias, reactivos y material didáctico para las materias de Ciencias Naturales, Química, Biología y Anatomía necesarios para que los estudiantes se vayan familiarizando con cada uno de ellos, brindando de esta forma una educación de calidad.